دانلود NAMD 2.14 نرم افزار شبیه سازی دینامیک مولکولی
NAMD نرم افزار شیمی برای شبیه سازی محاسبات دینامیک مولکولی در مقیاس نانو Nanoscale Molecular Dynamics است که قادر به انجام مدلسازی انواع روش های محاسباتی است. نرم افزار NAMD یک کد دینامیک مولکولی موازی برای سیستم عامل ویندوز، لینوکس و مک است که از جم شیمی دانلود می کنید که برای شبیه سازی با عملکرد بالا سیستم های زیستی مولکولی بزرگ طراحی شده است. بر اساس اشیاء موازی Charm ++ ، NAMD برای شبیه سازی های معمولی به صدها هسته و برای بزرگترین شبیه سازی به بیش از 500000 هسته می رسد.
NAMD از برنامه گرافیکی مولکولی محبوب VMD برای راه اندازی شبیه سازی و تجزیه و تحلیل مسیر استفاده می کند، اما همچنین باAMBER ، CHARMM و X-PLOR سازگار است. NAMD به صورت رایگان با کد منبع باز منتشر می شود. شما می توانید NAMD را خودتان بسازید یا فایل های باینری را برای طیف گسترده ای از سیستم عامل ها بارگیری کنید. آموزش های ما نحوه استفاده از NAMD و VMD برای مدل سازی بیومولکولی را به شما نشان می دهد.
