دانلود LAMMPS 2024 Win/Linux نرم افزار لمپس شبیه ساز دینامیک مولکولی شیمی

2 اردیبهشت , 1403

0 5,278 خواندن این مطلب 2 دقیقه زمان میبرد

دانلود LAMMPS نرم افزار تخصصی لمپس شبیه ساز دینامیک مولکولی شیمی

LAMMPS نرم افزار لمپس شبیه ساز اتمی و مولکولی شیمی بزرگ مقیاس به شدت موازی می باشد. این نرم افزار با در اختیار داشتن میدان نیروهای متنوع فراهم کننده بستری مناسب برای شبیه سازی سیستم های مختلف از سیستم های اتمی و مولکولی گرفته تا انواع پروتئین ها و سیستم های زیستی می باشد. از مهمترین ویژگی های این نرم افزار می توان به توان بالای آن در شبیه سازی سیستم های پر ذره اشاره نمود. نسحه لینوکس، ویندوز 32 و 64 بیتی نرم افزار LAMMPS لمپس در ادامه از جم شیمی دانلود نمایید.

LAMMPS یک نرم افزار شبیه سازی می باشد که بر اساس نظریه ی دینامیک مولکولی کار می کند. دینامیک مولکولی در ابتدا در فیزیک نظری در دهه 1950 استفاده شد اما امروزه با گسترش حیطه کاربرد آن در علم مواد و زیست مولکولی نیز بکار می رود و قابلیت شبیه سازی سیستم های زیستی و مهندسی را دارا می باشد. این نرم افزار با در اختیار داشتن میدان نیروهای (Force Field) متنوع فراهم کننده ی بستری مناسب برای شبیه سازی نمونه های مختلف از سیستم های اتمی و مولکولی گرفته تا انواع پروتئین ها و سیستم های زیستی می باشد. از مهمترین ویژگی های این نرم افزار می توان به توان بالای آن در شبیه سازی سیستم های پر ذره اشاره کرد.واژه ی LAMMPS مخفف عبارت Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator می باشد.

این بسته ی محاسباتی بر اساس نظریه ی دینامیک مولکولی (MD) کار می کند که در ابتدا در فیزیک نظری در دهه 1950 استفاده شد اما امروزه بیشتر در علم مواد و زیست مولکول بکار می‌رود و همان گونه که بیان شد لمپس قابلیت شبیه سازی سیستم های زیستی و مهندسی را دارا می باشد.

در مورد ساختارهای شبیه سازی شده با استفاده از افزار LAMMPS می توان به موارد زیر اشاره نمود:

سیستم های پریودیک
ذرات درشت دانه
مولکول های ارگانیک
فلزات
پلیمرها
DNA
پروتئین
ذرات کروی و بیضوی با اندازه معین
و …

ویژگی های فنی نرم افزار لمپس

نرم افزار LAMMPS با استفاده از زبان برنامه نویسی C++ تهیه گردیده و توسعه دهنده ی آن Sandia National Laboratories می باشد که این بسته ی محاسباتی را تحت پروانه GPL منتشر کرده است. از مهمترین ویژگی های فنی این نرم افزار می توان به موارد زیر اشاره نمود:

قابلیت اجرا شدن به صورت موازی و سریال
اجرای شبیه سازی ها با استفاده از فایل Input
قابلیت محاسبات بر روی GPU ها
قابلیت توسعه پذیری بالا
اپن سورس بودن
قابلیت اجرای چند شبیه سازی به وسیله ی یک فایل Input
قابلیت جفت شدن با سایر نرم افزارها
…

خروجی های نرم افزار LAMMPS

با استفاده از شبیه سازی های انجام شده توسط بسته ی محاسباتی لمپس می توان بسیاری از ویژگی های ترمودینامیکی و کلاسیکی سیستم های مورد بررسی را بدست آورد. تعدادی از مهمترین خروجی های حاصل از اجرای بسته محاسباتی لمپس که با استفاده از آن می توان خواص مکانیکی و ترمودینامیکی مختلفی از سیستم شبیه سازی شده را محاسبه نمود را در قسمت زیر فهرست کرده ایم:

مهمترین خروجی های نرم افزار لمپس عبارتند از:

Log file شامل اطلاعات ترمودینامیکی سیستم شبیه سازی شده
خروجی از مکان و سرعت هریک از اتم های شبیه سازی شده در هر لحظه دلخواه از زمان شبیه سازی
نمایش مقادیر انرژی، دما، فشار و … اتم های شبیه سازی شده
میانگین گیری فضایی و زمانی از مشخصات تک تک اتم ها
ارائه خروجی قابل نمایش گرافیکی از رفتار سیستم در بازه های زمانی شبیه سازی در فرمت هایی مختلف از قبیل XYZ, XTC, DCD, CFG

برای دانلود LAMMPS 2024 Win/Linux نرم افزار لمپس شبیه ساز دینامیک مولکولی شیمی روی لینک های دانلود کلیک کنید.