دانلود Open3DQSAR 2.3 نرم افزار کیوسار سه بعدی

Open3DQSAR نرم افزار شیمی برای محاسبات کیوسار سه بعدی 3D-QSAR ارتباط کمی ساختار – فعالیت و میدان های برهمکنش مولکولی (MIF) در شیمی محاسباتی رایگان دانلود کنید. Open 3D QSAR یک برنامه منبع باز است که با هدف اکتشاف فارماکوفور توسط آنالیز کمومتریکس یا chemometric کمومتری با توان بالا در زمینه های تعامل مولکولی (MIFs) انجام می شود. Open3DQSAR می تواند پتانسیل فضایی، چگالی الکترون و میدان های پتانسیل الکترواستاتیکی MM/QM تولید کند.

علاوه بر این، می‌تواند فایل‌های باینری GRIDKONT تولید شده توسط فیلدهای GRID، CoMFA/CoMSIA (خروجی از SYBYL با کمک یک اسکریپت SPL کوچک)، و فیلدهای تعامل شبکه MOE (خروجی از و MOE با کمک یک اسکریپت SVL کوچک) را وارد کند. متعاقباً، Open3DQSAR تجزیه و تحلیل شیمی‌سنجی PLS سریع و خودکار MIF را انجام می‌دهد که به سرعت پیش‌بینی بسیاری از مدل‌های 3D-QSAR را با استفاده از ترکیب‌های مختلف آموزش/آزمایش، طرح‌های برهم‌نهی، روش‌های انتخاب متغیر و درهم‌سازی داده‌ها، و غیره، تولید و به چالش می‌کشد. عملکرد محاسباتی بالا است. از طریق اجرای الگوریتم های موازی برای تولید MIF، ساخت و اعتبارسنجی مدل PLS، انتخاب متغیر به دست آمده است.

ویژگی ها و امکانات نرم افزار Open3DQSAR:

• ادغام یکپارچه با OpenBabel، PyMOL، COSMOsar3D، TURBOMOLE، FIREFLY، GAMESS-US، GAUSSIAN، MOE، MOLDEN، Molecular Discovery GRID
• محاسبات چند رشته ای MIF (هم MM و هم QM) ؛ پشتیبانی از میدان نیروی MMFF94 با تخصیص خودکار انواع اتم ها به ساختارهای مولکولی ایمپورت شده
• خروجی جامع، از جمله پایگاه داده های مولکولی SDF، نقشه های سه بعدی و بسیاری از نمودارهای مختلف برای سهولت ارزیابی فوری نتایج در PyMOL، MOE، Maestro، SYBYL و gnuplot
• رابط COSMOsar3D برای محاسبه MIF های محلی مبتنی بر پروفایل σ COSMO (LSP) از داخل Open3DQSAR
• رابط به تمام بسته‌های QM اصلی (مانند TURBOMOLE، GAUSSIAN، FIREFLY، GAMESS-US، MOLDEN) امکان محاسبه چگالی الکترون QM و نقشه‌های سه بعدی پتانسیل الکترواستاتیک را از داخل Open3DQSAR می‌دهد.
• رابط به GRID کشف مولکولی برای محاسبه GRID MIF از داخل Open3DQSAR